Águas de São Pedro je obec v juhovýchodnej Brazílii v štáte São Paulo. Nachádza sa 184 kilometrov od hlavného mesta štátu. Na iba 3,61 kilometroch štvorcových, je druhá najmenšia brazílska obec, pokiaľ ide o rozlohu. V roku 2010 mala 2 707 obyvateľov.
Águas de São Pedro sú doslova „Vody svätého Petra“ a názov je odvodený od minerálnych prameňov na jej území a polohe, obec pred založením bola súčasťou obce São Pedro (svätý Peter).